О сезоне: Четвёртый сезон начинается с членами экспедиции, работающими в поте лица чтобы сохранить крохи энергии от разряженного Модуля Нулевой Точки. Тем временем, их вовсю разыскивает полковник Картер на «Аполлоне». Доктор Вейр находится на грани смерти, когда Маккей решает активизировать асуранских нанороботов в её теле чтобы спасти её жизнь. Затем, он составляет дерзкий план по краже асуранского МНТ с помощью Вейр. Но команде удаётся сбежать лишь чудом, а Вейр оказывается в плену. Картер становится новым командиром Атлантиса, хотя многие члены экспедиции надеются спасти Вейр