После того как была открыта тайна девятого шеврона команда исследователей Stargate идет в беспилотный корабль, названный Судьбой, эксперимент начатый Древними в разгаре их цивилизации, но так и не законченный.
И теперь простая разведка превращается в никогда заканчивающуюся миссию, поскольку команда Вселенной Stargate обнаруживает, что судно неспособно возвратиться на Землю.
Команда попадет в далекие пределы вселенной, соединяющейся с каждым из ранее начатых Stargates, таким образом выполняя оригинальную миссию Судьбы.
Проблемы возникнут, хотя, поскольку судно входит в диапазон помещенных столетий Stargates перед Судьбой, и команда неспособна управлять навигацией судна. Если кто-то оставлен позади, нет никакого способа вернуться за ними, добавляя к драме столкновения с новыми гонками, врагами и приключениями.

Stargate Universe дебютирует как двухчасовая премьера на Sci Fi. После премьеры Stargate Universe примет регулярный почасовой слот Летом 2009.